生物有机肥虽然好，但使用不当也出不了好效果，甚至会影响作物生长。首先，使用时要注意腐熟程度，未腐熟的生物有机肥不能直接用，施到土壤里会继续发酵，产生高温烧伤作
生物有机肥虽然好，但使用不当也出不了好效果，甚至会影响作物生长。首先，使用时要注意腐熟程度，未腐熟的生物有机肥不能直接用，施到土壤里会继续发酵，产生高温烧伤作物根系，还会滋生病菌和害虫。一定要用完全腐熟的产品，或者提前腐熟后再使用。
然后是使用时间，最好在作物播种前或移栽前施入，作为基肥使用，这样能让肥料和土壤充分混合，为作物整个生长周期提供养分。如果作为追肥，要在作物生长旺盛期前施入，比如蔬菜定植后、果树萌芽前，施入后及时浇水，帮助作物吸收。
还要注意使用方法，生物有机肥适合沟施、穴施或撒施后翻耕，不要直接撒在土壤表面，这样容易被雨水冲刷流失，也不利于根系吸收。另外，不要和强酸强碱的农药或化肥混合使用，会杀死生物有机肥里的有益微生物，降低肥效。使用时要适量，不是越多越好，过量使用会导致土壤养分失衡，影响作物生长。